Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ulk3Q3U3Q1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ulk3Q3U3Q1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ulk3Q3U3Q1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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