Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T3

Brms1l, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1lQ3U1T3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brms1lQ3U1T3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brms1lQ3U1T3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brms1lQ3U1T3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brms1lQ3U1T3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms