Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem35bQ3U0Y2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem35bQ3U0Y2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms