Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ccdc136Q3TVA9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Ccdc136Q3TVA9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ccdc136Q3TVA9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ccdc136Q3TVA9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Ccdc136Q3TVA9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms