Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Calr4Q3TQS0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Calr4Q3TQS0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Calr4Q3TQS0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Calr4Q3TQS0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms