Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdnep1Q3TP92 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctdnep1Q3TP92 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms