Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Smarca4Q3TKT4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Smarca4Q3TKT4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Smarca4Q3TKT4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Smarca4Q3TKT4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms