Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stt3bQ3TDQ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stt3bQ3TDQ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stt3bQ3TDQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stt3bQ3TDQ1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stt3bQ3TDQ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stt3bQ3TDQ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stt3bQ3TDQ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stt3bQ3TDQ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stt3bQ3TDQ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stt3bQ3TDQ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stt3bQ3TDQ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms