Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDN2

Faf2, FAS-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf2Q3TDN2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Faf2Q3TDN2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Faf2Q3TDN2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Faf2Q3TDN2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faf2Q3TDN2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Faf2Q3TDN2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf2Q3TDN2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf2Q3TDN2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf2Q3TDN2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf2Q3TDN2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf2Q3TDN2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf2Q3TDN2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf2Q3TDN2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms