Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc69Q3TCJ8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms