Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem248Q3TBN1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem248Q3TBN1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem248Q3TBN1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem248Q3TBN1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem248Q3TBN1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem248Q3TBN1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem248Q3TBN1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem248Q3TBN1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem248Q3TBN1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem248Q3TBN1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem248Q3TBN1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem248Q3TBN1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem248Q3TBN1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem248Q3TBN1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem248Q3TBN1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem248Q3TBN1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem248Q3TBN1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem248Q3TBN1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem248Q3TBN1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem248Q3TBN1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem248Q3TBN1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem248Q3TBN1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem248Q3TBN1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem248Q3TBN1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms