Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3X8

Phactr1, Phosphatase and actin regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr1Q2M3X8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phactr1Q2M3X8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr1Q2M3X8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr1Q2M3X8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr1Q2M3X8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr1Q2M3X8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr1Q2M3X8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr1Q2M3X8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr1Q2M3X8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr1Q2M3X8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Phactr1Q2M3X8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phactr1Q2M3X8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phactr1Q2M3X8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms