Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm1123Q1RME4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm1123Q1RME4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms