Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf3ip1Q149C2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf3ip1Q149C2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Traf3ip1Q149C2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Traf3ip1Q149C2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
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