Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne7Q0VE82 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne7Q0VE82 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cpne7Q0VE82 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne7Q0VE82 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms