Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700061G19RikQ08EE8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700061G19RikQ08EE8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms