Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gata4Q08369 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata4Q08369 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata4Q08369 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms