Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calb2Q08331 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calb2Q08331 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Calb2Q08331 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms