Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cnn2Q08093 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnn2Q08093 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnn2Q08093 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms