Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnn1Q08091 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnn1Q08091 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnn1Q08091 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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