Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf3Q07104 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gdf3Q07104 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gdf3Q07104 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms