Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cab39Q06138 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cab39Q06138 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms