Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Igsf9Q05BQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Igsf9Q05BQ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igsf9Q05BQ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igsf9Q05BQ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igsf9Q05BQ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igsf9Q05BQ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms