Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a1Q05722 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a1Q05722 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a1Q05722 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms