Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rcn1Q05186 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rcn1Q05186 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rcn1Q05186 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms