Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk18Q04899 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk18Q04899 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk18Q04899 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cdk18Q04899 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk18Q04899 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms