Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox13Q04891 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox13Q04891 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox13Q04891 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms