Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nf1Q04690 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nf1Q04690 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms