Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smpd1Q04519 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd1Q04519 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd1Q04519 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms