Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnd1Q03719 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnd1Q03719 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnd1Q03719 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnd1Q03719 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms