Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NfiaQ02780 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NfiaQ02780 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms