Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp39Q02525 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp39Q02525 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms