Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Col1a2Q01149 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col1a2Q01149 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col1a2Q01149 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms