Protein–RNA interactions for Protein: Q00898

Serpina1e, Alpha-1-antitrypsin 1-5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1eQ00898 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Serpina1eQ00898 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serpina1eQ00898 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serpina1eQ00898 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serpina1eQ00898 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serpina1eQ00898 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serpina1eQ00898 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serpina1eQ00898 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serpina1eQ00898 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serpina1eQ00898 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serpina1eQ00898 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serpina1eQ00898 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serpina1eQ00898 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Serpina1eQ00898 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serpina1eQ00898 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serpina1eQ00898 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serpina1eQ00898 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serpina1eQ00898 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serpina1eQ00898 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms