Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Serpina1cQ00896 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Serpina1cQ00896 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Serpina1cQ00896 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms