Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SeleQ00690 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SeleQ00690 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SeleQ00690 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SeleQ00690 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SeleQ00690 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SeleQ00690 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SeleQ00690 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeleQ00690 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SeleQ00690 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SeleQ00690 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SeleQ00690 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SeleQ00690 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SeleQ00690 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms