Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pax8Q00288 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax8Q00288 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax8Q00288 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms