Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VldlrP98156 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VldlrP98156 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VldlrP98156 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VldlrP98156 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VldlrP98156 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VldlrP98156 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VldlrP98156 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VldlrP98156 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VldlrP98156 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VldlrP98156 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VldlrP98156 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VldlrP98156 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VldlrP98156 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VldlrP98156 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms