Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab33aP97950 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab33aP97950 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab33aP97950 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab33aP97950 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab33aP97950 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab33aP97950 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab33aP97950 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab33aP97950 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab33aP97950 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab33aP97950 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab33aP97950 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab33aP97950 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab33aP97950 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab33aP97950 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab33aP97950 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab33aP97950 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab33aP97950 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab33aP97950 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab33aP97950 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab33aP97950 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab33aP97950 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab33aP97950 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab33aP97950 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab33aP97950 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab33aP97950 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab33aP97950 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms