Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brca2P97929 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brca2P97929 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brca2P97929 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brca2P97929 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brca2P97929 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca2P97929 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brca2P97929 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca2P97929 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brca2P97929 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brca2P97929 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brca2P97929 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brca2P97929 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca2P97929 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca2P97929 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca2P97929 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca2P97929 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca2P97929 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca2P97929 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca2P97929 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca2P97929 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca2P97929 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca2P97929 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca2P97929 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca2P97929 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brca2P97929 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Brca2P97929 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms