Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc35b1P97858 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc35b1P97858 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc35b1P97858 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc35b1P97858 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms