Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata5P97489 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gata5P97489 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata5P97489 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gata5P97489 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gata5P97489 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gata5P97489 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gata5P97489 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata5P97489 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gata5P97489 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gata5P97489 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms