Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Npas2P97460 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npas2P97460 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Npas2P97460 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Npas2P97460 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Npas2P97460 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Npas2P97460 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Npas2P97460 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Npas2P97460 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Npas2P97460 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Npas2P97460 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms