Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nbr1P97432 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nbr1P97432 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nbr1P97432 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms