Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec1P97353 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec1P97353 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec1P97353 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sec1P97353 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec1P97353 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec1P97353 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec1P97353 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec1P97353 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec1P97353 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec1P97353 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec1P97353 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms