Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pkp1P97350 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pkp1P97350 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkp1P97350 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms