Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim43cP86449 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim43cP86449 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms