Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldb1P70662 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ldb1P70662 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ldb1P70662 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb1P70662 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb1P70662 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb1P70662 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb1P70662 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb1P70662 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb1P70662 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb1P70662 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb1P70662 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb1P70662 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb1P70662 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb1P70662 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb1P70662 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb1P70662 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb1P70662 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb1P70662 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb1P70662 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb1P70662 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb1P70662 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb1P70662 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldb1P70662 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldb1P70662 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ldb1P70662 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldb1P70662 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb1P70662 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb1P70662 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb1P70662 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb1P70662 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb1P70662 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb1P70662 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb1P70662 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb1P70662 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ldb1P70662 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb1P70662 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb1P70662 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ldb1P70662 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb1P70662 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb1P70662 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb1P70662 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb1P70662 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb1P70662 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb1P70662 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb1P70662 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ldb1P70662 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb1P70662 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb1P70662 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb1P70662 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb1P70662 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms