Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp9xP70398 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp9xP70398 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp9xP70398 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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