Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DccP70211 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DccP70211 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DccP70211 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DccP70211 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DccP70211 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DccP70211 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DccP70211 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DccP70211 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DccP70211 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DccP70211 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DccP70211 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DccP70211 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DccP70211 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DccP70211 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DccP70211 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DccP70211 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DccP70211 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DccP70211 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DccP70211 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DccP70211 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DccP70211 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DccP70211 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DccP70211 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DccP70211 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DccP70211 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DccP70211 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DccP70211 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DccP70211 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DccP70211 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DccP70211 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DccP70211 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
DccP70211 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DccP70211 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DccP70211 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DccP70211 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
DccP70211 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
DccP70211 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DccP70211 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DccP70211 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DccP70211 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DccP70211 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DccP70211 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DccP70211 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DccP70211 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DccP70211 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DccP70211 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DccP70211 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DccP70211 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DccP70211 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
DccP70211 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DccP70211 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DccP70211 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DccP70211 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DccP70211 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DccP70211 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DccP70211 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
DccP70211 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DccP70211 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DccP70211 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DccP70211 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DccP70211 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DccP70211 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DccP70211 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DccP70211 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DccP70211 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DccP70211 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DccP70211 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DccP70211 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DccP70211 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DccP70211 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DccP70211 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DccP70211 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DccP70211 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DccP70211 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DccP70211 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DccP70211 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DccP70211 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DccP70211 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DccP70211 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DccP70211 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DccP70211 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DccP70211 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DccP70211 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DccP70211 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DccP70211 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DccP70211 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DccP70211 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DccP70211 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DccP70211 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DccP70211 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DccP70211 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DccP70211 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DccP70211 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DccP70211 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DccP70211 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DccP70211 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DccP70211 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DccP70211 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DccP70211 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms